Eu tenho instalando algumas aplicações em Java aqui no meu Ubuntu 7.10 e geralmente elas abrem com uma tela vazia, sem nenhum componente sendo exibindo, como na figura abaixo:

Eu instalei o IRPF 2008 (sim, existe uma versão pra Linux), o Druid (este eu já até removi do pc) e mais recentemente o Netbeans 6.1. E com todos eles aconteceu o mesmo problema.
Procurando na internet, eu descobri que isso é um conflito com o Compiz e existem duas soluções:
1) Desabilitar o Compiz. Vá em Sistema > Preferência > Aparência e na aba “Efeitos Visuais” escolha a opção “Nenhum”. Isso irá resolver o problema, mas irá deixar o Ubuntu muito simples. Se você não quer desabilitar o Compiz, escolha a opção segunda opção.
2) Definir uma variável de ambiente. Essa solução resolve o problema e não é necessário desabilitar o Compiz. Execute o seguinte comando para editar o arquivo /etc/profile:
sudo gedit /etc/profile
E então adicione as linhas abaixo no final do arquivo e salve:
# resolvendo o conflito do java com compiz
AWT_TOOLKIT=MToolkit
export AWT_TOOLKIT
Reinicie o pc - um logout já resolve - para poder abrir qualquer aplicação Java normalmente.
Há tempos eu venho tentando mudar de vez pro Linux, mas sempre acabo enchendo a paciência e voltando pro Windows. Querendo ou não, as coisas lá (no windows) são muito fáceis e por aqui (no Linux) tenho sempre que recorrer ao terminal. Nada contra o terminal, até gosto, mas tem hora que não dá pra perder tempo e o “next, next da vida” é ideal nestas situações.
O Ubuntu parece que está resolvendo muito bem esse problema de tudo ter que recorrer ao terminal e os vídeos de demonstração do Compiz e XGL não só são muito populares como também são responsáveis por vários novos adeptos ao sistema. Vide abaixo:

No passado, eu tentei usar o Mandrake, que agora é Mandriva, e o Fedora. Teve também uma época em que eu estava com problemas no HD e fiquei usando o Kurumin direto do CD. Essas tentativas foram válidas, porque eu fiquei mais experto em ambiente linux e consegui algumas coisas com mais facilidade no Ubuntu.
Outra coisa que facilitou a minha vida foi o fato de que há uma grande e muito ativa comunidade de usuários na internet e praticamente tudo que eu busco no Google com a palavra “ubuntu” retorna vários resultados, por exemplo “ubuntu dvd maker” e “ubuntu compiz howto“. É claro que 90% das coisas estão em inglês, mas em português também é possível achar bastante coisas.
UPDATE: A galera do trabalho está muito interessada em instalar o Ubuntu também e eu acabei escrevendo um tutorial de instalação para guia-los.
Abraços!